En 1999 una extraña nave alienígena cae sobre la isla Macross, la humanidad deja de lado sus diferencias tras años de guerra y decide estudiar los secretos que lleva consigo. Es el año 2004 y Roy Fokker llega a la isla Macross para servir como piloto de pruebas de un prototipo experimental llamado varitech, el cual ha sido realizado usando parte de la tecnología hallada en la nave. Mientras tanto, a miles de años luz de distancia, a la raza de guerreros gigantes llamada zentraedi se le asigna una importante misión, recuperar esa nave cueste lo que cueste. Como el nombre lo indica, esta serie explora el periodo seminal de la saga de macross, varios años antes de la invasión zentraedi y poniendo enfasis en roy fokker como protagonista. este titulo consta de 37 números y cuenta con un viejo conocido en los guiones, Bill Spangle.