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Nach der Wasserstoffhypothese ist die erste eukarytoische Zelle ein Chimer aus Bakterium innerhalb einer Archaea gewesen (es hatte also eine Archaea-Membran, die aus Isopreneinheiten besteht). In unseren Genen sind tatsächlich diese Synthesebausteine enthalten, jedoch nicht um Membran herzustellen sondern Grundelemente von Hormonen, Vitaminen, Steroiden oder Pigmenten.

Bakterien können nicht so groß wachsen wie Eukaryonten, weil sie geometrisch eingeschränkt sind. Ihre Hauptenergiequelle sind keine Mitochondrien, sondern der Protonentransport über die Membran ins Periplasma. Der Transport korreliert mit dem Verhältnis von Volumen zu Oberfläche. Größere Bakterien wären also nicht in der Lage, diese Art der Energieumwandlung aufrecht zu erhalten.